廣西交通職業技術學院設置有交通信息工程系、機電工程系、管理工程系、建筑工程系、航海工程系(籌建中)等。
廣西交通職業技術學院專業設置有計算機應用技術、計算機網絡技術、道路橋梁工程技術(公路方向和橋梁方向)、公路監理、環境監測與治理技術、港口工程技術、鐵道工程技術等11個專業或專門化方向,專業面涵蓋交通行業、鐵道行業等領域。開設了"汽車電子技術","現在代汽車檢測與維修","汽車技術服務營銷","公路工程機械","電子電器"等專業。物流管理、電子商務,人力資源管理、公路運輸與管理、財務會計等專業。建筑工程技術、建筑工程技術(工程質量檢測方向)、工程造價(建筑工程方向)、城鎮規劃、市政工程技術、園林工程技術、安全技術管理等7個專業組成的建筑類專業群。機電一體化技術(港口與船舶電氣化方向)、船舶工程技術、航海技術、輪機工程技術。